Brøndby IF meddelte lørdag, at han træder tilbage med øjeblikkelig virkning, og at Sten Lerche er konstitueret formand. Per Bjerregaard forklarede sit farvel til bestyrelsen med, at uro, rygter og myter om hans person i medierne har påvirket klubben uheldigt.
Hans afsked blev hilst velkommen af fanklubben og andre, fordi Brøndby IF har store økonomiske og sportslige problemer. Per Bjerregaard siger selv i et interview, at han måske burde have forladt klubben tidligere.
Samtidig roste flere fodboldledere Per Bjerregaard for at skabe den fænomenale fremgang, Brøndby fik i sine første år og som har gjort klubben til en af de mest succesrige i nyere tid.
Midt i maj nedjusterede Brøndby IF forventningerne til 2012 og advarede om, at der kunne være behov for at styrke koncernens likviditet i de kommende måneder. Søndag tabte Brøndby 1-2 i Aalborg til AaB.